Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcg3Q99P81 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcg3Q99P81 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms