Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab27bQ99P58 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms