Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rad54l2Q99NG0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rad54l2Q99NG0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Rad54l2Q99NG0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rad54l2Q99NG0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms