Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cep41Q99NF3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep41Q99NF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms