Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims1Q99NE5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rims1Q99NE5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rims1Q99NE5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rims1Q99NE5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms