Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcgf6Q99NA9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcgf6Q99NA9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pcgf6Q99NA9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcgf6Q99NA9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms