Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl3Q99N95 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms