Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kremen1Q99N43 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kremen1Q99N43 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kremen1Q99N43 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms