Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ms4a6dQ99N07 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms