Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tdrd1Q99MV1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd1Q99MV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd1Q99MV1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms