Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erc1Q99MI1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erc1Q99MI1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms