Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PtprtQ99M80 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprtQ99M80 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprtQ99M80 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PtprtQ99M80 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms