Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epdr1Q99M71 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epdr1Q99M71 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms