Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp5lQ99LH9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5lQ99LH9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms