Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RtcbQ99LF4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RtcbQ99LF4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms