Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clint1Q99KN9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clint1Q99KN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clint1Q99KN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms