Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ubxn2aQ99KJ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ubxn2aQ99KJ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms