Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI0

Aco2, Aconitate hydratase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco2Q99KI0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Aco2Q99KI0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aco2Q99KI0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms