Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pls3Q99K51 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pls3Q99K51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms