Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrabdQ99JY4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TrabdQ99JY4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms