Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl22Q99JN2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl22Q99JN2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms