Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smim11aQ99J19 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Smim11aQ99J19 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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