Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riok1Q922Q2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok1Q922Q2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok1Q922Q2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms