Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Clip1Q922J3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Clip1Q922J3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Clip1Q922J3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms