Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf7Q922B6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf7Q922B6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms