Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HlcsQ920N2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HlcsQ920N2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HlcsQ920N2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms