Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Odf3Q920N1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf3Q920N1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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