Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca5Q91ZW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca5Q91ZW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms