Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin3bQ91ZU9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin3bQ91ZU9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms