Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PccaQ91ZA3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PccaQ91ZA3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PccaQ91ZA3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PccaQ91ZA3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PccaQ91ZA3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PccaQ91ZA3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PccaQ91ZA3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms