Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp3Q91W36 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp3Q91W36 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms