Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cbx7Q8VDS3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cbx7Q8VDS3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx7Q8VDS3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms