Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnajc28Q8VCE1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dnajc28Q8VCE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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