Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ApobrQ8VBT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ApobrQ8VBT6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms