Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Z5

Cacnb1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb1Q8R3Z5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb1Q8R3Z5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb1Q8R3Z5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb1Q8R3Z5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacnb1Q8R3Z5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacnb1Q8R3Z5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms