Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab11fip5Q8R361 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab11fip5Q8R361 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab11fip5Q8R361 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms