Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q0

Rptor, Regulatory-associated protein of mTOR, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptorQ8K4Q0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RptorQ8K4Q0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RptorQ8K4Q0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RptorQ8K4Q0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms