Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufs8Q8K3J1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ndufs8Q8K3J1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufs8Q8K3J1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms