Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I8

Defb19, Beta-defensin 19, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb19Q8K3I8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defb19Q8K3I8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defb19Q8K3I8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms