Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyripQ8K3I4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyripQ8K3I4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms