Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cdk5rap2Q8K389 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk5rap2Q8K389 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms