Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrtm1Q8K377 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm1Q8K377 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms