Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prpf39Q8K2Z2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms