Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Paf1Q8K2T8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Paf1Q8K2T8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Paf1Q8K2T8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms