Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Neil3Q8K203 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Neil3Q8K203 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms