Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prkd3Q8K1Y2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkd3Q8K1Y2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkd3Q8K1Y2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms