Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek9Q8K1R7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek9Q8K1R7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek9Q8K1R7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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