Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbrd1Q8K0B2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms