Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klre1Q8CJC7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klre1Q8CJC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.5 ms