Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Celf3Q8CIN6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Celf3Q8CIN6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Celf3Q8CIN6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms